医院是重庆市规模最大、实力最强，集医疗、教学、科研、公益四项中心职能于一体的大型三级甲等中医龙头医院，是卫生部国际紧急救援中心网络医院、国家爱婴医院、国家药物临床试验机构、北京中医药大学非直属附属医院、成都中医药大学附属重庆中医院和第四临床医学院、首批国家中医药传承创新工程重点中医医院建设单位。医院荣登香港艾力彼“2018届中医医院100强”排行榜第13位，位居西部前列。
医院现分江北区南桥寺院部和渝中区道门口院部，占地173亩，建筑面积近20万平方米。现编制床位2500张，开放床位3000张，临床科室32个，医技科室10个。2018年门诊量205万人次，年出院病人6.8万人次。有国家临床重点专科5个（皮肤科、针灸科、肿瘤科、肾病科、护理学），国家中医药管理局重点建设学科（中医皮肤病学）和重点专科（皮肤科、针灸科、肿瘤科、肾病科、妇科、脑病科、肛肠科、骨伤科、肝病科、护理学）共11个，国家中医药管理局重点研究室1个（湿疹中医外治法重点研究室）、重庆市重点实验室2个（中医药防治自身免疫疾病、中西医结合诊治皮肤病）、二级实验室2个（生化实验室、免疫微生物实验室），卫生部诊断鉴定机构1个（化妆品皮肤病鉴定机构），重庆市市级临床重点专科1个（麻醉科），重庆市医学重点学科1个（皮肤科学），重庆市中医药重点学科10个（中医皮肤病学、针灸学、中医肾病学、中医痹病学、中医肝胆病学、中医肛肠病学、中医妇科学、中药炮制学、中医脾胃病学、中医肿瘤病学、中医护理学）和重点专科6个（风湿病科、治未病中心、儿科、眼科、乳腺科、脾胃病科），重庆市中西医结合医疗中心3个（中西医结合皮肤病防治中心、中西医结合脑血管病康复治疗中心、颈腰腿痛治疗中心），重庆市医疗质量控制中心2个（皮肤科医疗质量控制中心、美容皮肤科医疗质量控制中心），院内研究所3个（皮肤病研究所、针灸研究所、古验方与中药制剂研究所），是中国-新加坡中医药国际合作基地（重庆）、国家区域中医（专科）诊疗中心（皮肤、针炙）、重庆市中医特色诊疗工程技术中心、重庆市院士专家工作站、国家级和重庆市博士后科研工作站（针灸、皮肤）、中医药传承博士后工作站、重庆市中医护理临床技术指导中心、重庆市皮肤病临床医学研究中心。医院设有中国中医药文献检索中心重庆分中心、全国针灸临床中心重庆分中心，办有《中国中医急症》杂志。重庆市中医药学会、重庆市中西医结合学会、重庆市针灸学会和重庆市中医药行业协会均挂靠在医院。
医院现有在岗职工3700余人，其中：高级职称440余人，国医大师2人，首届全国名中医1人，重庆市首席医学专家3人，全国名老中医药专家传承工作室专家11人，国务院政府特殊津贴专家7人，首批重庆市医学领军人才1人，重庆市级学术技术带头人9人，市级名中医30人，国家和省级师带徒导师16人，重庆市高端后备人才7人，硕博士820余人，博士和硕士研究生导师56人。
医院拥有医用直线加速器、大型数控放疗系统、1.5T核磁共振（3台）、64排128层及16排螺旋CT（共3台）、X射线血管造影系统、直接数字化放射成像系统、乳腺X射线摄影系统、全自动生化免疫流水线等大型医疗设备200余台，医疗设备总值5亿多元。
医院先后获国家各级科技成果奖130多项，其中“一种治疗更年期综合征的中药复方制剂及制备方法”获中华中医药学会科技发明一等奖。医院研制了参麦注射液、丹桃合剂、降糖丸、更年宁心胶囊等多个国家新药。获得药监局生产批文的院内制剂228种。承担国家级、省部级、重庆市卫生计生委建设项目和科研项目300多个。
医院先后荣获全国五一劳动奖状、全国创先争优先进基层党组织、全国文明单位、全国精神文明建设先进单位、全国青年文明号、全国卫生系统先进集体、全国中西医结合先进单位、卫生部抗震救灾先进集体、中华全国总工会工人先锋号、全国人文爱心医院、全国中医药应急工作先进集体、全国中医医院优质护理服务先进单位、国家卫计委雅安芦山抗震救灾工作突出单位、重庆市群众满意的医疗卫生机构、重庆市白求恩精神示范医院、重庆市中医药产业发展突出贡献单位、重庆市职工职业道德建设标兵单位、重庆市园林式单位等荣誉100多项。医院创先争优工作得到各级领导的充分肯定，2010年12月6日，时任中共中央政治局常委、中央书记处书记、国家副主席习近平视察了医院，勉励医院继续努力，把工作做得更好。
重庆市渝中区第三人民医院
暂无等级
重庆市渝中区新华路142号
重庆医科大学附属口腔医院
三级甲等
重庆市渝中区上清寺路5号
重庆长航医院
二级甲等
重庆市渝中区大坪正街162号
重庆医科大学附属儿童医院
三级甲等 儿童医院
重庆市渝中区中山二路136号
重庆市第四人民医院
三级甲等 综合医院
重庆市渝中区健康路1号
重庆医科大学附属第一医院
三级甲等
重庆市渝中区袁家岗友谊路1号
重庆市大坪医院
三级甲等
重庆市渝中区大坪长江之路10号
重庆市第八人民医院
二级甲等
重庆市人民路191号