多数单纯性肾盏憩室无临床症状，仅在静脉肾盂造影时偶然发现。当憩室继发感染或结石时，可出现腰痛、肉眼血尿、脓尿、发热及尿频、尿急、尿痛等表现。不伴结石者少有尿路感染症状。症状表现的严重程度与憩室的大小无关，一些小的肾盏憩室，也可引起明显的腰痛。
可能与肾盏连接部压力增加或引流不畅有关。由于肾盏憩室通道很窄，结石极少能通过憩室颈排入肾盏。如有排石会出现肾绞痛。憩室合并结石时，表面的肾实质常形成瘢痕或萎缩。瘢痕形成常导致憩室通道闭合。此时，结石位于肾实质的腔内，与集合系统完全分隔。憩室通道关闭可引起急性感染和肾脓肿。肾上极脓肿常导致有症状的胸腔积液。感染也可导致黄色肉芽肿性肾盂肾炎。
Ulreich等报道1例患者在行静脉肾盂造影时，肾盏憩室自发性破裂，憩室受外伤而发生破裂至今尚无文献报道。理论上较大的憩室是可以出现外伤性破裂的。Wulfsohu等报道1例患者因肾盏憩室行肾切除术后，高血压恢复正常。高血压与肾盏憩室的关系目前尚不清楚。
