1.常规检查 白细胞总数及中性粒细胞增多，红细胞与血红蛋白减少则因出血程度而异，血小板可减少。肠炎型者可有血样或黏液血便。
2.细菌的分离和鉴别 取血、脓、痰、脑脊液、淋巴结穿刺液等材料送检。一般检查程序包括显微镜检查、培养、鼠疫噬菌体裂解试验和动物实验，简称四步试验，以上四步均获阳性结果可确诊鼠疫。
3.血清学检查
①间接血凝反应(IHA)。是将鼠疫特异性抗原(或抗体)致敏的红细胞与被检材料混合，用于检查和测定鼠疫抗体(或抗原)。是一种快速、敏感、特异性高的血清学诊断方法。不仅可检查活菌和死菌，也可检查可溶性抗原以及污染、腐败的材料。70年代于我国得到普遍推广，是目前行之有效的快速诊断方法之一。
②荧光抗体染色镜检(IFA)。具有快速、敏感度及特异性较高的优点，但有假阳性或假阴性。
③放射免疫沉淀试验(RIP)。敏感、高度特异，不仅是目前鼠疫监测、查源较为理想的方法之一，特别是轻型和不典型病例的追索诊断，作为补充IHA的不足，具有一定的实用价值。
④葡萄球菌A蛋白的血凝改进方法(SPA-IHA)。比间接血凝的检出率高，方法更简便，适于野外基础实验使用。
4.以传统的“四步检验”法为“金标准”，用4对引物聚合酶链反应(PCR)检测鼠疫动物材料，从而探索一种鼠疫快速诊断的方法。(来源《中国媒介生物学及控制杂志》)
方法 毒力测定和4对引物PCR按常规方法进行。
结果 在150份动物材料中，传统的“四步检验”作为金标准共检出阳性62份，而PCR法共检出阳性52份，经χ^2检验，差异无统计学意义(χ^2=1.42，P〉0.05)。PCR实验在4h内全部完成。
结论 4对引物PCR法具有快速、敏感等优点，可以用于鼠疫的快速诊断和流行病学调查。
