1.真菌组织病理学
真菌组织病理学是深部真菌感染的重要诊断方法，组织中真菌的鉴定标志着病原学诊断水平。免疫组织化学根据真菌抗原性不同将真菌分类 。需要检查的人群是多引起角膜炎、泪小管炎等真菌感染症状的患者。
2.皮肤涂片显微镜检查
皮肤涂片显微镜检查是检查血、尿、脑脊液、胸膜液、心包液及腹膜液中，是否有细菌的存在的一种检查方法。可诊断链球菌、葡萄球菌、炭疽杆菌、麻风杆菌、结核杆菌、各种真菌感染、阿米巴、黑热病、丝虫病、疥疮、螨虫等所致之皮肤病。
3.免疫病理检查
免疫病理检查是利用免疫学的原理进行的一种检查，如：皮肤斑贴试验、癣菌素试验、过敏原筛选等。
