鉴别诊断：
一、 与细菌性腹泻鉴别
排便次数明显超过平日习惯的频率，粪质稀薄，水分增加，每日排便量超过200g，或含未消化食物或脓血、粘液。腹泻常伴有排便急迫感、肛门不适、失禁等症状。腹泻分急性和慢性两类。急性腹泻发病急剧，病程在2～3周之内。细菌性腹泻一般由非O-I群弧菌和产生肠毒素的大肠杆菌(ETEC)引起。前者多数病人的腹泻伴剧烈腹痛和发热;1/4的病人粪便呈血性。大肠杆菌引起的腹泻一般病程较短。两者与霍乱的鉴别有赖于病原学检查。
二、如果部分的粪便呈洗肉水样或痢疾样，则需与细菌性痢疾(是志贺菌属(痢疾杆菌)引起的肠道传染病。临床表现主要有发冷、发热、腹痛、腹泻、里急后重、排粘液脓血样大便。中毒型菌痢起病急骤、突然高热、反复惊厥、嗜睡、昏迷、迅速发生循环衰竭和呼吸衰竭，而肠道症状轻或缺如，病情凶险。菌痢常年散发，夏秋多见，是我国的常见病、多发病。本病有有效的抗菌药治疗，治愈率高。疗效欠佳或慢性变多是因为未经正规治疗、未及时治疗、使用药物不当或耐药菌株感染。)鉴别，后者多伴腹痛和里急后重，粪便量少，呈脓血样。
三、与急性砷中毒相鉴别。急性砷中毒以急性胃肠炎为主要表现，粪便为黄色或灰白水样，常带血，严重者尿量减少，甚至尿闭及循环衰竭等。检查粪便或呕吐物砷含量可明确诊断。
四、霍乱应与各种细菌性食物中毒相鉴别，如金黄色葡萄球菌、变形杆菌、蜡样芽胞杆菌及副溶血如金黄色葡萄球菌、变形杆菌、蜡样芽胞杆菌及副溶血弧菌引起者，各种食物中毒起病急，同食者常集体发病，常先吐后泻，排便前有阵发性腹痛，粪便常为黄色水样，偶带脓血。
另外：古典生物型、埃尔托生物型和0139型霍乱弧菌的鉴别，见表1。
表1 古典、埃尔托和0139型霍乱弧菌鉴别
鉴别试验 古典型 埃尔·托型 0139型
VI组霍乱噬菌体裂解试验(106颗粒单位) + -(+) -
V组霍乱噬菌体裂解试验 - + -
多粘菌素B敏感试验 + -(+) -
鸡血清凝集试验V-P试验 -(+) +(-) +
V-P试验 - + (-) + -
绵羊血球溶血试验 - +(-) +
0/129弧菌抑制试验(二氨基二异丙基碟碇敏感试验) + + -
01群血清凝集试验 + + -
0139血清凝集试验 - - +
