1.蛲虫可以合并淋病或其他性传播性疾病，必须与淋病等性传播疾病相鉴别。
2.虫体进入腹腔，可导致蛲虫性腹膜炎和肉芽肿，常被误诊为肿瘤和结核病等。
3.与其他因素引起的幼女阴道炎鉴别：
外阴局部卫生不佳：患儿母亲及保教人员不注意患儿外阴清洁，大便后处理不当，或用污染的纸擦抹肛门，使肠道细菌侵入阴道，引起阴道炎。
异物：如花生米、豆类、发夹、别针、小石头等塞入阴道，由于异物造成阴道上皮损伤，而发生继发性感染。
继发性外阴、阴道炎：幼女在上呼吸道感染或泌尿道感染后，细菌通过灰尘直接传入阴道而引起感染。
特异性阴道炎：滴虫或霉菌性阴道炎，在婴幼儿罕见。
